在全市各级党委的坚强领导下，工会组织始终坚持以“组织起来，切实维权”为工作主线，持续扩大组织覆盖，增强凝聚力，不断焕发基层工会的生机与活力。“党工共建”成为推动新经济组织工会建设的核心机制。截至2001年12月，全市所有县区均成立新经济组织工会组建工作领导小组，系统推进建会工作。

2002年，全市共建立社区工会146家、村级工会431家，发展会员8.07万人。市总工会明确“哪里有职工，哪里就要建立工会组织”，将非公企业建会和农民工入会作为重点任务，成立农民工工作领导小组，加强组织指导。到2006年底，全市已建立进城务工人员工会组织220个，发展进城务工人员入会6.5万人。

为贯彻省委、市委《关于进一步加强新时期工会工作的意见》，市总工会自2006年起与市委组织部协作，实施“党工共建”目标管理，建立市、县、乡镇（街道）和工业园区四级考核体系。2009年，在全市开展“双措并举、二次覆盖”活动，各县区相继建立区域性工会、行业工会40多家，发展会员1.8万多人。

2010年7月，全总提出“两个普遍”重点目标，即依法推动企业普遍建立工会组织、普遍开展工资集体协商，进一步明确工会维护职能的方向。同年，全市非公企业工会“三公开四统筹”活动覆盖面达60%，全年新建工会569家，增长11%，新增会员5.4万人，增长8.1%，非公企业建会率和职工入会率分别达到92.8%和81.5%。

自2005年起，市总工会每年与县区总工会签订目标责任书，开展争创“全省工会工作十强县及模范县区”活动，灌云、东海、海州、新浦、连云等县区工会先后获得表彰，有效激发基层创优热情。

新经济组织建会工作坚持“成熟一个，发展一个，巩固一个，示范一片”。自1985年起，乡镇企业、中外合资企业工会组建稳步推进。到1989年6月，全市共有111家乡镇企业建立工会，发展会员1.26万人；同年年底，中外合资企业建会16家，会员1454人。

工会干部队伍建设是全市工会工作的一大亮点。1987年，市总干校与中国工运学院联合办学，系统开展工会干部岗位培训，设置工运史、工会学、劳动法学、企业管理及工会领导学五门课程，专职工会主席每月学习45课时。1988至2011年间，市总连续多年组织各类干部及职工代表培训，内容涵盖工会业务、民主管理、《工会法》、《劳动法》等法律法规，累计培训超1.2万人次，显著提升干部队伍专业素质。

“职工之家”建设不断注入新内涵。2000年，根据省总要求，市总调整建家标准，增加协调劳动关系、帮扶下岗职工、促进再就业等内容，并用三年时间开展合格、示范企业工会创建活动。到2009年，全市90%以上基层工会建成合格职工之家。1978至2012年间，多家基层工会和分工会（小组）荣获全国模范职工之家和职工小家称号。

工会干部配备持续优化。1996年9月，市委明确要求按“四化”标准和德才兼备原则选配工会干部。2006至2008年间，市、县区总工会主席全部实现按同级副职配备。2011年底，全市共有129名各级工会主席实现高配，2012年，所有省级以上开发区和95%的乡镇（街道）工会主席由同级党政副职担任，“选优配强”机制全面落实。

通过党建引领、目标管理、培训强化和典型带动，全市工会组织在扩大覆盖、维护权益、服务职工等方面发挥了重要作用，为新时期工运事业写下扎实而鲜活的一页。